為滿足日益增長的臨床需求，神經(jīng)病理中心一直積極開展分子病理檢測項目，尤其自2021年第五版WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類指南（簡稱WHO CNS5）發(fā)布后，我們迅速啟動了DNA甲基化譜分析項目，并與2023年7月在院內(nèi)通過了新技術(shù)新項目評審，正式進入臨床檢測。

目前檢測平臺日益完善，包括焦磷酸測序平臺、熒光原位雜交平臺、熒光定量PCR平臺、二代測序平臺，以及具有獨立知識產(chǎn)權(quán)的國內(nèi)首個DNA甲基化譜分析平臺（該平臺既可以對中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤進行準(zhǔn)確分類，又可防止國人遺傳信息資源外泄），處于國內(nèi)中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分子病理檢測的領(lǐng)先地位?，F(xiàn)已完成分子病理檢測1萬余例，為中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的診斷、分級、治療和預(yù)后評估提供了重要依據(jù)。

下面將神經(jīng)病理中心目前開展的分子病理檢測項目進行簡要介紹，并在文末附：中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分子病理檢查流程（附件一）和WHO CNS5 指導(dǎo)下的神經(jīng)病理報告（附件二）。

目前神經(jīng)病理中心開展的分子病理檢測項目包括：

一、MGMT啟動子甲基化

檢測方法：焦磷酸測序法（PSQ）

檢測意義：具有MGMT啟動子甲基化的患者對替莫唑胺更加敏感

二、染色體缺失/擴增、基因拷貝數(shù)缺失/擴增及基因融合

檢測方法：熒光原位雜交法（FISH）

檢測內(nèi)容：目前開展的FISH項目包括染色體1p/19q缺失、7號染色體擴增、基因拷貝數(shù)缺失/擴增（CDKN2A、EGFR、MYCN、MDM2、CDK4等）、基因融合（MYC、CIC、RELA、MN1、FOXR2、EWSR1、BRAF等）。

三、神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤精準(zhǔn)診療基因檢測（V1.0）（DNA）

檢測方法：二代測序法

檢測內(nèi)容：該panel整合了多平臺多分子靶標(biāo)的高通量靶向測序項目，基因列表如下：

檢測意義： 1.預(yù)測診斷分型 2.預(yù)測臨床預(yù)后 3.預(yù)測藥物有效性

四、兒童腫瘤精準(zhǔn)診療基因檢測（DNA+RNA）

檢測方法：二代測序法

檢測內(nèi)容：該panel最大優(yōu)勢是包括＞1700種融合基因形式，基因列表如下：

檢測意義：1.預(yù)測診斷分型 2.預(yù)測臨床預(yù)后 3.預(yù)測藥物有效性

五、DNA甲基化譜分析

檢測方法：DNA甲基化譜分析法

檢測內(nèi)容：通過甲基化芯片檢測對全基因組935K個位點的甲基化水平進行分析，并基于甲基化分析結(jié)果進行中國人群數(shù)據(jù)庫比對，從而對中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤進行分類。

DNA甲基化譜分析結(jié)果包含了MGMT啟動子甲基化狀態(tài)（該結(jié)果是評價患者對替莫唑胺藥物敏感性的重要因素）、DNA甲基化譜聚類情況（該結(jié)果會提示腫瘤的分類情況，幫助醫(yī)生做出整合病理診斷）以及拷貝數(shù)變異情況（擴增或缺失）。舉例如下：

檢測意義：WHO推薦的有效且重復(fù)性高的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類方法，可為腫瘤整合診斷提供重要的參考和依據(jù)。尤其對于組織特征不顯著、常規(guī)分子病理檢測無法明確以及罕見的腫瘤類型和亞型，DNA甲基化譜分析是（目前）確定其診斷的唯一方法。

附件

附件一：中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分子病理檢查流程

值得注意的是，準(zhǔn)確的分子病理診斷離不開準(zhǔn)確的組織病理學(xué)診斷。標(biāo)本的病理評估極其重要，因為腦腫瘤組織存在很大的異質(zhì)性，只有選出合適的病理蠟塊做分子病理檢測，才能保證分子病理報告的準(zhǔn)確性和可信性。

附件二：WHO CNS5 指導(dǎo)下的神經(jīng)病理報告